Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06328 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06328 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06328 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06328 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06328 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06328 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06328 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06328 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06328 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06328 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06328 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms