Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Eb1P04230 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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H2-Eb1P04230 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Eb1P04230 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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H2-Eb1P04230 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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H2-Eb1P04230 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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H2-Eb1P04230 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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