Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01789 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01789 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01789 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01789 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01789 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01789 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01789 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01789 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms