Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01652 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01652 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01652 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01652 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01652 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01652 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01652 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01652 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01652 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01652 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01652 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01652 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01652 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01652 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01652 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01652 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01652 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01652 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01652 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01652 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01652 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01652 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01652 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
P01652 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01652 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01652 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P01652 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01652 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01652 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms