Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Robo1O89026 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Robo1O89026 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo1O89026 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo1O89026 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Robo1O89026 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms