Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tcn2O88968 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcn2O88968 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcn2O88968 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms