Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AurkcO88445 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AurkcO88445 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms