Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme6O88425 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme6O88425 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme6O88425 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms