Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx12O70493 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx12O70493 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx12O70493 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms