Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtssO70370 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtssO70370 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtssO70370 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtssO70370 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtssO70370 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtssO70370 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtssO70370 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CtssO70370 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtssO70370 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CtssO70370 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtssO70370 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtssO70370 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtssO70370 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtssO70370 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtssO70370 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtssO70370 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtssO70370 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtssO70370 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtssO70370 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtssO70370 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtssO70370 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtssO70370 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtssO70370 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtssO70370 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtssO70370 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtssO70370 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CtssO70370 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtssO70370 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtssO70370 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtssO70370 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CtssO70370 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtssO70370 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms