Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AurkbO70126 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkbO70126 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AurkbO70126 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AurkbO70126 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AurkbO70126 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms