Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Supt5hO55201 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt5hO55201 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt5hO55201 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms