Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2a2O55143 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2a2O55143 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms