Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Sept7O55131 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Sept7O55131 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sept7O55131 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Sept7O55131 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sept7O55131 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms