Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copb2O55029 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb2O55029 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms