Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NlkO54949 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NlkO54949 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NlkO54949 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NlkO54949 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NlkO54949 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NlkO54949 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NlkO54949 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NlkO54949 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NlkO54949 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NlkO54949 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NlkO54949 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms