Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarce1O54941 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarce1O54941 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms