Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CaluO35887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CaluO35887 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CaluO35887 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CaluO35887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CaluO35887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CaluO35887 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CaluO35887 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CaluO35887 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CaluO35887 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CaluO35887 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CaluO35887 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms