Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfrsf11aO35305 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms