Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe40O35185 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe40O35185 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms