Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eftud2O08810 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eftud2O08810 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms