Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckarO08786 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckarO08786 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CckarO08786 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CckarO08786 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CckarO08786 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CckarO08786 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CckarO08786 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CckarO08786 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CckarO08786 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CckarO08786 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CckarO08786 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms