Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ascl4M0QW46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms