Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1oL7MU04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms