Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c2J3QNM1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34c2J3QNM1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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