Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20918J3QN17 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20918J3QN17 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms