Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20815J3KMI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20815J3KMI0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms