Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.6 ms