Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms