Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp9yF8VPU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9yF8VPU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms