Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10378F6XQQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm10378F6XQQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm10378F6XQQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms