Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r40F6W043 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn2r40F6W043 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms