Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm340F6RGI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms