Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp17lbE9Q9U0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lbE9Q9U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp17lbE9Q9U0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms