Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TrdnE9Q9K5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms