Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85cE9Q6B2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms