Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdc1E9Q5K9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms