Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tarbp1E9Q368 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tarbp1E9Q368 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tarbp1E9Q368 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tarbp1E9Q368 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms