Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3250E9Q1M3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3250E9Q1M3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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