Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt78E9Q0F0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt78E9Q0F0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms