Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9972E9Q053 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9972E9Q053 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms