Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd1E9PZ26 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd1E9PZ26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms