Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph10bE9PYQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms