Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp54bE9PXC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54bE9PXC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms