Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3002E9PW72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3002E9PW72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3002E9PW72 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms