Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp839E9PUU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp839E9PUU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms