Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms