Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930467E23RikD3Z1P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms