Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nxpe3B9EKK6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nxpe3B9EKK6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms