Protein–RNA interactions for Protein: B2RWJ3

Tmem240, Transmembrane protein 240, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem240B2RWJ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem240B2RWJ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem240B2RWJ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem240B2RWJ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem240B2RWJ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem240B2RWJ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms